Биоинформатик - Bioinformatician / Computational Biologist (Agri-Biotech)

Мы строим систему для R&D в агро-биотехнологиях, которая объединяет генетические и экспериментальные данные и позволяет моделировать поведение микроорганизмов в разных условиях. Наша цель — превратить каждый новый лабораторный эксперимент в часть умной, развивающейся системы, которая помогает командам принимать обоснованные решения при разработке биологических продуктов.

Мы ищем опытного Биоинформатика - эксперта Bioinformatician / Computational Biologist.

В этой роли Вы будете:

• Создавать и развивать воспроизводимую и масштабируемую систему аннотации и биологической интерпретации геномных и мультиомиксных данных микроорганизмов.
• Совместно с AI-инженером преобразовывать сырые геномные и omics-данные в структурированные количественные признаки для ML/AI моделей и формализовывать связь между молекулярными характеристиками и фенотипами.
• Участвовать в проектировании структуры данных: определять, какие уровни молекулярной информации включаются в модель и какие признаки действительно несут предсказательную ценность.
• Совместно с микробиологом определять, какие in vitro / in planta эксперименты необходимы для улучшения качества предсказаний моделей и какие данные являются критически недостающими.

• Высшее образование в области биоинформатики, вычислительной биологии или смежной естественно-научной области.
• Подтвержденный опыт построения воспроизводимых и автоматизированных пайплайнов аннотации и анализа геномов микроорганизмов.
• Практический опыт интеграции нескольких типов omics-данных (транскриптомика, метаболомика, GEM и др.) в единую систему признаков.
• Понимание функциональной организации геномов микроорганизмов и механизмов, влияющих на их поведение.
• Способность формализовывать биологические гипотезы в виде количественных признаков.

Компетенции:

• Структурное мышление: способность превращать разрозненные данные, идеи и требования в логичную систему.
• Кросс-функциональная коммуникация: способность переводить биологические концепции на язык математики (для ML) и наоборот (для микробиологов).
• Находчивость: способность находить рабочие решения в условиях нехватки времени, данных и ресурсов.
• Автономность: способность самому определять следующие шаги и нести ответственность за результат.
• Гибкость и адаптивность: способность быстро воспринимать изменения в приоритетах и адаптироваться к новым условиям.

Будет преимуществом:

• Практический опыт работы с микроорганизмами, релевантными для сельского хозяйства (почвенные бактерии, эндофиты и др.), и понимание молекулярных механизмов взаимодействия микробов и растений.
• Опыт тесной работы с ML-инженерами: от совместного проектирования признаков (feature engineering) до анализа интерпретируемости моделей.
• Опыт работы с формальными онтологиями или графами знаний для структурирования сложной биологической информации.

Мы предлагаем:

• официальное трудоустройство (трудовой договор/ГПХ);
• возможный формат работы: на территории работодателя в г. Казань/удалённо;
• возможность постоянного профессионального развития, участие в интересных проектах;
• поддержка наставника на всех этапах работы;
• уровень вознаграждения обсуждается с кандидатами на собеседовании.