Биоинформатик

Plastilin — это AgroTech-компания, которая меняет будущее сельского хозяйства. Мы сотрудничаем с ведущими агрохолдингами и используем технологии генетического редактирования, анализ геномных данных и цифровизацию, для того чтобы совершить прорыв в селекции растений.

Наша миссия — создавать новые сорта, которые будут кратно превосходить существующие по урожайности, питательной ценности и устойчивости к вызовам меняющегося климата. Мы ищем в команду биоинформатика, который готов решать интересные задачи и напрямую влиять на продовольственную безопасность будущего.

https://plastilin.team/

Что предстоит делать:

• Анализировать данные секвенирования геномов (WGS, GBS, ddRAD, SNPseq) для ключевых сельскохозяйственных культур.

• Разрабатывать, оптимизировать и поддерживать автоматизированные пайплайны для обработки NGS-данных.

• Создавать новые и применять существующие алгоритмы для предсказания фенотипов по генотипам и прогнозирования результатов скрещиваний.

Требования к кандидату:

• Уверенное владение Python, R, bash

• Опыт с NGS данными (2 и 3 поколения), понимание принципов работы инструментов и специфики файлов на разных этапах анализа

• Опыт работы с языками масштабирования пайплайнов (Nextflow, Snakemake)

• Опыт работы с серверами на базе Linux

• Уверенное знание статистики, молекулярной биологии, генетики

• Свободное владение английским языком для чтения научной литературы и технической документации

• Знание статистической основы GWAS, BLUP, геномной селекции - опыт работы с основными инструментами и интерпретации результатов

Плюсом будет:

• Опыт работы с SQL

• Знание основ селекционного процесса

• Опыт с базовыми инструментами ML

Условия:

• Минимальная нагрузка по документообороту

• Офис в Москве, в районе метро Киевская/Фрунзенская

• Полная занятость

• Социальная защищенность - прозрачные условия трудоустройства, трудоустройство по ТК РФ, фиксированная белая зарплата

• Возможность стоять у истоков первого в России сервиса рекомендательных систем для дизайна растений и видеть, как ваша работа влияет на целую отрасль.