Биоинформатик (тематика - онкология)

О нас

Мы работаем в областях молекулярной и клинической онкологии, ведем фундаментальные исследования и проекты по трансляционной медицине, разработки диагностических систем и инновационных терапевтических подходов.

В нашу мультидисциплинарную команду мы ищем специалиста-биоинформатика с опытом работы в медицинских или биологических проектах. Важен научный интерес в областях онкологии или генетики и желание вести разработку новых алгоритмов обработки данных.

Возможен быстрый профессиональный рост и освоение новых методик и пайплайнов анализа данных. Нам доступны передовые методы исследований – мы можем предложить большой набор типов данных для анализа.

У нас молодой коллектив подготовленных специалистов: биологов, медиков, биоинформатиков, биостатистиков и data scientist’ов.

Вы будете в команде, где сообща решают задачи, и есть возможность учиться у коллег с широким набором компетенций. Вас подключат к выполнению уникальных научных разработок, и, если интересует научная карьера, возможно участие в конференциях, выполнение диссертационной работы.

Уровень з/п определяется по итогам выполнения тестового задания.

Задачи:

• биоинформатический анализ результатов молекулярного-генетических исследований: полногеномное секвенирование, таргетное секвенирование ДНК и РНК, bulk РНК-секвенирование, анализ метилирования ДНК;
• системно-биологический анализ данных, включая анализ мультиомиксных данных;
• разработка и дополнение пайплайнов анализа данных;
• работа с базами данных: парсинг общедоступных биомедицинских баз данных, работа с локальными базами данных;
• анализ качества данных, включая применение методов статистического анализа, визуализации данных;
• подготовка научных публикаций, патентов.

Требования:

• оконченное высшее образование, специальности: биоинформатика, биофизика, биоинженерия или математика/программирование с дополнительной специализацией в биоинформатике;
• уверенные навыки программирования: знание R (Bioconductor), Python (Biopython, Pandas, Numpy как минимум, знание/применение других библиотек будет преимуществом);
• уверенное владение Linux, знание Bash, навыки работы в командной строке;
• опыт работы с NGS-данными на уровне разработки биоинформатических пайплайнов анализа данных (геном, транскриптом, метилом, таргетное секвенирование панелей генов);
• опыт работы с Docker, Git;
• опыт работы с SQL;
• знание биомедицинской статистики;
• опыт научной деятельности не менее 2 лет;
• аналитический склад ума, педантичность, методичность, ориентированность на результат;
• английский язык не ниже уровня Intermediate.

• Опционально:

• знание алгоритмов и методик системно-биологического анализа;
• знание хотя бы одного из следующих языков программирования: Perl, C++, Julia, Java, JavaScript;
• владение хотя бы одним из следующих инструментов: MathCAD, MatLab, Wolfram Matematica, Octave;
• опыт математического моделирования, навыки создания ML-моделей,
• наличие дополнительного образования (повышение квалификации) в областях молекулярной биологии/онкологии/клеточной биологии/генетики.

Условия:

• Стабильная организация, которой не страшен кризис.
• Достойный уровень з/п, обсуждается индивидуально в зависимости от навыков.
• Работа в офисе, гибридный формат работы возможен, полностью дистанционный формат работы не предусмотрен.
• Прикрепление к ведомственной поликлинике ФМБА.
• Инновационная наука, проекты, имеющие прикладное значение, ориентированные на борьбу с самыми сложными болезнями.
• Возможность публиковать результаты исследований, использовать для кандидатских и докторских диссертаций.
• Возможно обучение (на рабочем месте или на курсах повышения квалификации) в процессе.