Разработчик биоинформатической платформы (НИР)

О проекте

Приглашаем присоединиться к научно-исследовательскому проекту по разработке открытой биоинформатической платформы для анализа геномных данных. Проект реализуется в рамках гранта ФТ 2.1.

Обязанности

• Анализ и разработка объектно-ориентированной модели для представления сценариев анализа генетических данных

• Создание парсеров для языков CWL и WDL с использованием технологии JavaCC

• Разработка генераторов кода на языках CWL, WDL и Nextflow

• Формализация ограничений по отображению информации из сценариев анализа данных

• Проектирование и реализация графической нотации для визуализации данных

• Разработка веб-интерфейса для интерактивного просмотра и редактирования сценариев

• Создание тестовых наборов данных для проверки разработанных компонентов

Требования

• Высшее образование в области компьютерных наук/биоинформатики

• Опыт разработки на Java и JavaScript

• Знание языков CWL, WDL, Nextflow будет преимуществом

• Опыт работы с UML диаграммами

• Понимание принципов объектно-ориентированного программирования

• Навыки работы с системами контроля версий (Git)

• Умение работать с большими объемами данных

Условия

• График работы: полный рабочий день

• Срок проекта: до 01.12.2025

• Место работы: Университет «Сириус», федеральная территория «Сириус»

Преимущества

• Участие в значимом научном проекте

• Работа с передовыми технологиями в области биоинформатики

• Возможность публикации результатов исследования

• Профессиональный рост в сфере разработки биоинформатических решений