Контроль соблюдения санитарно-противоэпидемических мероприятий. Специалист следит за правильностью дезинфекции и стерилизации медицинского инструментария.
Ведение учёта инфекционных больных. Специалист составляет статистические отчёты о заболеваемости и контролирует выполнение противоэпидемических мероприятий медицинским персоналом.
Микробиологический контроль объектов внешней среды. Специалист отбирает пробы воды и смывы с поверхностей для лабораторных исследований.
Координация взаимодействия. Помощник эпидемиолога координирует работу с лабораторной службой, санитарно-эпидемиологической станцией и другими подразделениями медицинского учреждения по вопросам эпидемиологической безопасности.