Основные задачи связаны с генетикой диабета первого типа и его развитием, анализом аутоиммунных процессов и поиском триггеров заболевания. Данные WGS, scRNAseq, TCRseq, BCRseq (в том числе scTCRseq и scBCRseq). При наличии желания (и оставшихся ресурсов после основных задач) возможен рост в какой-либо из других проектов лаборатории, связанных с scRNA-seq (в том числе и опухолей) и ST, WES опухолей, написанием пайплайнов и прочих.
Обязанности:
- Анализ NGS данных, особенно данных WGS/WES. Также возможна работа с данными scRNA-seq и scTCRseq
- Изучение генетических рисков диабета первого типа, поиск каузативных вариантов для диабета первого типа и изучение причин его развития работа со шкалами риска
- Реализация полученных результатов в понятном и чистом коде, описание находок
- Возможно участие в других проектах, связанных с аутоиммунными заболеваниями человека и иными заболеваниями
- Участие в написании статей.
Кого ожидаем увидеть:
- Есть бакалавриат или (немного желательнее) специалитет/магистратура в области биоинформатики или смежных областях (биология, биотехнология, биофизика etc.)
- Или есть опыт в мокрой биологии/программировании, но решил перепрофилироваться в биоинформатику
Ключевые навыки:
- Знание статистики, молекулярной биологии, принципов NGS, опыт работы с NGS в рамках учебы/курсов.
- Знакомство с базами данных dbSNP, ClinVar, OMIM.
- Python (numpy, pandas, scipy, scikit-learn, seaborn, matplotlib), умение или желание писать чистый код на Python (pep8).
- Знакомство с системами версионирования (git).
- Базовый bash (настроить себе окружение, запустить тул, написать простой скрипт для запуска тула).
Желательно:
- Базовое владение R.
- Базовый Machine learning
- Опыт работы с NGS за пределами учебного (работа в лабе, дипломный проект, пет-проекты, etc.)
- Знание иммунологии и/или опыт работы с аутоиммунными заболеваниями
Условия:
- Работа в ведущем техническом вузе страны, в городе Долгопрудный (Рядом со станцией Новодачная МЦД-1, или 15 минут от метро Физтех, Алтуфьево или Ховрино).
- Оформление в соответствии с ТК РФ, официальная заработная плата.
- Конкурентная заработная плата, которая обсуждается в зависимости от занятости в проекте.
- Возможности профессионального развития.
- Возможность бесплатного посещения бассейна и тренажерного зала.
В соответствии с ТК РФ, работники сферы образования обязаны предоставить справку о наличии (отсутствии) судимости и (или) факта уголовного преследования, срок изготовления которой может быть до 30 дней, просим заранее позаботиться о ее получении В соответствии с ТК РФ, работники сферы образования обязаны предоставить справку о наличии (отсутствии) судимости и (или) факта уголовного преследования, срок изготовления которой может быть до 30 дней, просим заранее позаботиться о ее получении (которую можно заказать бесплатно онлайн через портал ГосУслуги).