Биоинформатик / Специалист по полногеномному секвенированию

Обязанности:

• Участие в проекте полногеномного секвенирования ДНК различных видов животных (пчелы, домашняя коза, снежный баран, крупный рогатый скот, овца, карп, гусь, индейка, стерлядь);

• Подготовка и контроль качества образцов ДНК, включая создание SBS-библиотек, флуорометрическую оценку и биоанализ фрагментов;

• Проведение секвенирования с использованием платформ Illumina (и/или HiFi SMRT);

• Обеспечение требуемых характеристик покрытия генома (от 10X до 30X), объема данных (от 5 до 85 Gb) и длины ридов;

• Работа с фрагментированной и древней ДНК, оптимизация библиотек для низкокачественных образцов;

• Обработка данных секвенирования, анализ, контроль качества, подготовка результатов в формате FASTQ;

• Обеспечение хранения и предоставления данных на защищенном сервере.

Требования:

• Высшее образование в области биоинформатики, молекулярной биологии, генетики или смежных дисциплин;

• Опыт работы с технологиями секвенирования Illumina (опыт с HiFi секвенированием — преимущество);

• Навыки создания и валидации библиотек ДНК (в том числе из фрагментированного материала);

• Знание принципов анализа и обработки данных секвенирования (FASTQ, демультиплексирование, тримминг);

• Умение работать с биоинформатическими инструментами и платформами (FastQC, BWA, SAMtools, и т.п.);

• Опыт обеспечения хранения и передачи геномных данных по протоколам безопасности.

Преимущества:

• Опыт работы с секвенированием ДНК животных, в том числе сельскохозяйственных и редких видов;

• Участие в научных или прикладных проектах в области животноводства и селекции;

• Опыт доставки и логистики биообразцов при температурном контроле (до -70ºС);

• Знание нормативных требований к хранению и передаче данных в научных проектах.

⚙️ Условия:

• Работа в крупном исследовательском проекте с перспективой публикаций и карьерного роста;

• Конкурентная заработная плата (по итогам собеседования).